Todos os dias tanto na parte da manhã como a tarde existem operações de mergulho para credenciados. Existem certas regras e padrões a serem seguidos dentro da área do Parque Nacional Marinho de Fernando de Noronha. Luvas e facas são proibidas. Não se pode tocar e nem coletar nada do fundo.

Todos os mergulhos em Noronha são guiados por Instrutores ou Dive Masters. Sempre 1 instrutor para cada 4 mergulhadores. As saídas de mergulho sempre incluem 2 mergulhos em pontos diferentes. O Ibama só permite uma embarcação em cada ponto de mergulho, assim sendo, não se pode dar total garantia que quais serão os pontos de mergulho do dia seguinte. Os pontos geralmente são definidos na hora do embarque. Tendo em vista a quantidade e qualidade dos mergulhos de Noronha isso não é problema algum. Quando se fecha um pacote com 2 ou mais saídas, os mergulhos serão sempre em pontos diferentes.